蘆洲湧蓮寺的起源可追溯至清朝同治元年（1862），當時有二位比丘日本僧大機和尚與中國僧咸林和尚，自浙江舟山列島普陀山隱秀庵攜帶觀音佛祖與善才、龍女尊像，搭船出海募緣。途中遭遇颱風漂流至淡水口，清晨偶遇蘆洲頂竹圍人李佑欲渡船至迪化街經商。李佑許願若當日生意順利，必返船進香。當日果然大獲利潤，他依約返回進香，香爐隨即發爐，經擲筊指示佛祖意欲駐蹕蘆洲「貝局間口」現址。消息傳出後，由本鄉總理李宴林與地方士紳鳩眾迎奉，遂以草廬建廟，供奉觀音佛祖。

   同治十一年（1872），地方仕紳李宴林、李清水等人再度發起建廟，以瓦代茅，並增祀十八羅漢、韋馱、伽藍護法。至日治時期大正八年（1919），由區長蔡學韜、秀才李聲元與十三保正倡議，擴建為前殿觀音佛祖、後殿懋德宮奉祀延平郡王鄭成功，形成今日湧蓮寺兼具佛教與民間信仰的特色。

   戰後民國50年（1961）湧蓮寺翻修，民國70年（1981）再度擴建，歷時16年於1997年竣工，呈現今日宏偉壯觀的殿宇格局。同時，湧蓮寺也逐步制度化，於1977年獲准成立財團法人，並於1995年另設立「湧蓮慈善基金會」，長期投入清寒助學、濟貧扶弱等公益事務，發揮觀音佛祖慈悲濟世的精神。

   今日的湧蓮寺不僅是蘆洲居民信仰中心，更以三年一度「國姓醮」及佛祖聖誕法會聞名。其歷史從清末草創、日治擴建、戰後重修到現代慈善事業，既見證地方信仰的發展，也體現宗教在社會公益上的力量，成為新北市重要的宗教文化地標。